一、種籽清理除雜： 種籽在收獲、晾曬、包裝、運輸、貯藏中，難免會混進沙石、泥土、莖葉和其他雜物。除雜提高油的品質和出油率，減輕設備磨損、提高產量和降低能耗。 除雜采用振動篩，除雜后種籽含雜率<0.05%。

　　二、種籽剝殼及仁殼分離： 種籽剝殼在于提高出油率，減少油分損失，提高油質和餅粕質量，充分發揮制油設備的生產能力，減少設備的磨損和維修費用，降低生產用電力消耗，并有利于皮殼的綜合利用。 仁中含殼率<8%，殼中含仁<0.5%，水份要求10—12%。

　　三、霉變籽仁清除：種籽在收獲、晾曬、存放期間，難免因天氣和存放不當致使一些種籽發霉變質，清除霉變籽仁，以提高油的品質。牡丹籽仁是自然白色，只有剝殼后才能看出變質籽仁。變質籽仁只能用人工去揀，揀凈率要求≥99%。

　　四、炒料：炒料可起到凝聚油脂，調整料結構，改善油質品質，提高產量，降低動力消耗。 炒料采用導熱油炒鍋，炒料溫度130℃以下。烘炒時間40—50分鐘。

　　五、壓榨制油： 制油采用螺旋榨油機。榨油全過程不涉及任何化學添加劑，確保油品安全、衛生、無污染，天然營養不受破壞。

　　六、牡丹籽油的精煉工藝：牡丹籽油精煉采用物理和化學相結合的方法，其精煉采用高級食用油精煉設備精煉。

　　牡丹籽油脫膠： 毛油中的膠性雜質，以磷為主。磷脂等膠狀物的存在，不僅降低油的品質，而且在堿煉脫酸工序中能促使油脂與堿液之間產生過渡的乳化作用，增加皂角的分離難度，加重中性油的損失，因此應先行去除干凈。 水化脫膠，在攪拌下升溫至60℃，加入油中含磷量的4—5倍的沸水，水溫略高于油溫。必要時，水中溶入油重0.2%—0.3%的食鹽可提高水化效果。加水操作是水化最重要的階段，要認真控制加水量，水與油的溫度，攪拌及加水的速度等。水化時要經常用勺子在鍋內取樣觀察，視情況靈活掌握加水量及加水速度。加水完畢，當膠粒開始聚集，即開始慢速攪拌，并升溫至75℃，當液面呈明顯油路時，即停止攪拌，靜置3—4小時，冬季4—5小時。直至水化油腳與油脂分離合格，放出油腳，得脫膠油進入下一程序。牡丹籽油含磷脂較低，在生產中不必單獨進行脫膠，可與脫酸程序一并舉行。

　　牡丹籽油脫酸：油脂脫酸主要是除去毛油中的游離脂肪酸，以及油中的少量膠質、色素和微量金屬物質。脫酸操作是直接影響油脂精煉得油率和品質的重要因素之一。工業生產上應用最廣泛的是堿煉脫酸法。將清毛油泵入鍋內，攪拌均勻，使油溫升至60℃。同時進行快速攪拌，轉速為60轉/分，將計量好的堿液均勻噴灑入油中，繼續快速攪拌，使其與油充分混合。而后改為慢速攪拌，轉速為30轉/分。同時將溫度升至75℃，至油與皂粒呈明顯分離、易于沉淀時，停止鼓氣，讓皂粒沉降，靜置3小時，然后用稍高于油溫的熱水進行洗滌，以除盡油中殘存的皂粒等雜質。當油溫降至60℃開始過濾，進入下一程序。